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DIRECTORES
Dr. D. Luis Vázquez Martínez, Dr. D. Federico Morán Abad y Dr. D. Alfonso Valencia Herrera.
COORDINADOR
D. Juan Carlos Sánchez Ferrero.
ESCUELA EN LA QUE SE INSCRIBE EL CURSO
Escuela de Informática y Nuevas Tecnologías.
NÚMERO DE ALUMNOS
20.
PERFIL DEL ALUMNO
El curso está abierto a doctores, licenciados o estudiantes de cualquier carrera de Ciencias o Ingeniería. Sin embargo es recomendable que los alumnos tengan:
• Conocimientos elementales de biología molecular.
• Conocimientos básicos de manejo de computadores.
• Conocimientos de inglés.
OBJETIVOS
• Adquirir conocimientos elementales del sistema operativo Linux, de programación en Perl y de diseño e implementación de bases de datos relacionales. Linux, como otros sistemas operativos emparentados con Unix, es la plataforma preferida para el desarrollo y el uso de aplicaciones Bioinformáticas, Perl es un lenguaje de programación frecuentemente usado para el desarrollo de pequeñas aplicaciones bioinformáticas y las bases de datos relacionales son sistemas estándar de almacenamiento, análisis y consulta de datos.
• Familiarizarse con los tipos de datos que son objeto de análisis en la Bioinformática, y con las bases de datos en que dichos datos están almacenados y cómo se accede a ellas a través de la Internet.
• Conocer los tipos de herramientas y las estrategias generales de investigación usadas más frecuentemente en Bioinformática. Este objetivo es muy amplio y abarca técnicas y métodos enfocados a analizar y comparar secuencias de ácidos nucleicos, analizar y anotar genomas, predecir y comparar la estructura y la función de proteínas, diseñar fármacos optimizados para su interacción con centros activos de enzimas o receptores o con ácidos nucleicos, etc.
PROGRAMA
• Introducción a la Bioinformática.
• Nociones sobre el uso de computadores con sistema operativo tipo Linux.
• Programación básica con Perl.
• Nociones sobre bases de datos relacionales y servicios Web.
• Bases de Datos en Bioinformática.
• Herramientas y conceptos de análisis de secuencias de ácidos nucleicos.
• Herramientas y conceptos de análisis de secuencias de aminoácidos.
• Predicción de estructura secundaria y terciaria de proteínas.
• Filogenia.
• Arrays de DNA y análisis de datos.
• Proteómica y Bioinformática.
ACTIVIDADES PRÁCTICAS
El número de horas de clase dedicadas a temas que previsiblemente incluirán actividades prácticas con ordenador es de unas 75. Estas clases aparecen con fondo gris en el cronograma que se presenta más abajo. Las prácticas estarán organizadas por el mismo profesor que imparte la clase, que será también el que decida la duración de las mismas. No obstante, la recomendación general será dividir el tiempo de clase en dos mitades, una para teoría y otra para práctica. Si se cumple esta recomendación, el tiempo previsto de prácticas es de alrededor de 37 horas.
Está previsto organizar al menos dos sesiones dedicadas en su totalidad a la realización de prácticas. En la primera, las prácticas estarán centradas en "análisis de secuencias"; en la segunda, el tema será "predicción de estructura de proteínas". Las prácticas servirán para integrar y reforzar los temas tratados a lo largo de las jornadas anteriores, y tendrán una parte guiada y otra libre.
Por último, se ofrecerá a los alumnos la posibilidad de realizar prácticas adicionales, libres o apoyadas por un monitor, en horas extra, dependiendo de la disponibilidad del aula. En este sentido, nos gustaría recalcar el comentario que hacemos en la sección AULAS, de este documento.
PROFESORADO
• D. Alfonso Valencia, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas.
• Dª Ana Rojas, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas.
• D. Daniel Mozos, UCM.
• D. Federico Gago, Universidad de Alcalá de Henares.
• D. Federico Morán, UCM.
• D. Florencio Pazos, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC.
• D. Hernan Dopazo, Centro de Investigaciones Príncipe Felipe.
• D. Ildefonso Cases, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas.
• D. Javier Lacadena, UCM.
• D. José María Fernández González, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas.
• D. Juan Fernández Recio, Barcelona SuperComputing Center.
• D. Juan Carlos Sánchez Ferrero, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC.
• D. Luis Vázquez, UCM.
• Dª Mayte Villalba, UCM.
• D. Michael Tress, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas.
• D. Martin Krallinger, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas.
• D. Pedro A. Reche, UCM. |
